DNA Fingerprinting in Plants: Principles, Methods and Applications
Kurt Weising, Hilde Nybom, Kirsten Wolff and Günter Kahl, 2005.
DNAFingerprinting in Plants: Principles, Methods and Applications (2nd ed.).
CRC Press, Taylor & Francis Group, 444 pág., ISBN 0-8493-1488-7. Preço:
101,75
DNA Fingerprinting in Plants: Principles, Methods and Applications, agora na
sua 2ª edição totalmente revista, actualizada e ampliada, é um manual de
referência fundamental para os interessados nesta área.
O livro está organizado em nove Capítulos e apresenta, de maneira clara e
objectiva, várias técnicas de marcadores moleculares, das mais simples às mais
complexas, adequadas à análise de fingerprinting do DNA nas plantas,
descrevendo os protocolos passo a passo, discutindo os aspectos técnicos e
modificações introduzidas, a influência dos componentes e as condições das
reacções e a análise dos resultados.
Os Autores também incluem neste livro 1623 referências de artigos científicos
com estudos sobre a aplicação e importância dos métodos e uma listagem dos
programas de computador utilizados para avaliação de dados moleculares.
O primeiro Capítulo "Repetitive DNA: An Importante Source of Variation in
Eukaryotic Genomes" começa por referir a organização dos três genomas
presentes em plantas e apresenta de seguida, como fontes importantes da
variação do DNA, a biologia dos microsatélites, dos minisatélites e dos
elementos transponíveis.
O Capítulo 2 "Detecting DNA Variation by Molecular Markers" incide
sobre as estratégias utilizadas para detectar polimorfismos através de métodos
electroforéticos. Cada secção deste Capítulo começa com uma breve introdução
sobre os princípios e desenvolvimento histórico da respectiva metodologia, que
é seguida de uma descrição das propriedades, vantagens, desvantagens e áreas de
aplicação do referido marcador molecular.
O terceiro Capítulo "Laboratory Equipment" enumera o equipamento
necessário ao desenvolvimento
das várias metodologias, baseadas quer na reacção em cadeia da polimerase (PCR)
quer em reacções de hibridação.
O Capítulo 4 "Methodology" surge no seguimento do anterior. Começa
por apresentar as recomendações de segurança e protecção do utilizador,
agrupadas num conjunto de informações essenciais para se ter num laboratório. A
secção seguinte foi elaborada de forma a disponibilizar informações relevantes
sobre a recolha e armazenamento de material vegetal, extracção, purificação e
quantificação de DNA com descrição pormenorizada de vários protocolos. Nas
secções seguintes estão disponíveis protocolos simples e gerais, designadamente
para a digestão de DNA com enzimas de restrição, electroforese e revelação de
géis de agarose e poliacrilamida, hibridação de sondas, PCR, microsatélites,
AFLP, com breves comentários que permitem contornar problemas que
inevitavelmente aparecem na bancada.
No Capítulo 5 "Evaluation of Molecular Marker Data" são descritos
vários caminhos a seguir na interpretação e análise de dados eletroforéticos em
estudos de identificação de genótipos, de avaliação da diversidade genética e
análises de segregação e ligação para mapeamento genético.
Nos sexto e sétimo Capítulos, os Autores apresentam vários exemplos de
aplicação de fingerprinting de DNA em plantas, especialmente na identificação
de genótipos, genética de populações, sistemática, filogeografia e mapeamento
genético.
No Capítulo 8 "Which Marker for What Purpose: A Comparison" são
comparadas as várias metodologias de marcadores moleculares e a sua capacidade
de detectar e quantificar a variação genética, incluindo os custos e os
benefícios de cada metodologia.
No último Capítulo os Autores discutem as futuras técnicas, SNPs e análise de
microarrays de DNA, expondo os recentes avanços relativos à identificação e
detecção de polimorfismos nucleotídicos simples (SNPs) e encarando-os já como
os marcadores moleculares da terceira geração.
Filomena Nóbrega
Investigadora Auxiliar
Estação Florestal Nacional
Av. da República, Quinta do Marquês,
2780-159 Oeiras - Portugal
silva.lusitana@inrb.pt